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製造会社の関係性を取得する抗体情報検索モデルを作成した. その後, UniProt のタンパク質データベースを用い, 自動的に抗原となるタンパク質を検索/検出し, 製造会社と関連付け, リポジトリ化する抗体情報自動検索ツールを作成し, その性能の検証を行った. 【結果】抗体情報検索モデルの検証を行ったところ, 適合率100%, 再現率99.0%, F値99.5%という結果であった. 次に, 抗体情報検索ツールの性能の検証を行ったところ, 適合率は100%であったが, 再現率が39.8%と大きく減少し, 結果としてF値は56.9%と著しい信頼度の低下が見られた. そこで, その原因を調査したところ, 抗体情報が取得できなかった原因の75.8%は, 動物種が異なる同名タンパク質が UniProt データベースに登録されていたため, タンパク質を特定できなかったものであった. そのため, データベースを動物種別に再構築し, 再度検証を行ったところ, 再現率は79.6%まで上昇し, F値も88.6%という高い信頼率となった. 【考察】今回の抗体情報検索モデルについてはF値が99.5%という高い信頼性を示したため, このモデルは抗体情報取得に有効であると考えられた. また, 抗体情報検索ツールでは, 当初再現率が39.8%と, 著しい低下がみられたが, 動物種ごとにタンパク質データセットを編成し, 再検証した結果, 再現率が79.6%まで上昇し, F値も88.6%という信頼率まで改善された. また, 再構築後の抗体情報検索ツールについて, 論文別の信頼度調査を行ったところ, F値が0.8以上の論文が全体の80.9%を占めたことから, 本研究で作成した抗体情報検索ツールは, 研究者が抗体選定する際に有用であると考えられた. 今後この仕組みを改良/発展させることで, さらに多くの研究者に有用な抗体情報検索ツールを構築してゆきたいと考えている.", "subitem_description_type": "Abstract"}]}, "item_7_full_name_3": {"attribute_name": "著者別名", "attribute_value_mlt": [{"nameIdentifiers": [{"nameIdentifier": "60877", "nameIdentifierScheme": "WEKO"}], "names": [{"name": "Kinoshita, Naohiko"}]}, {"nameIdentifiers": [{"nameIdentifier": "60878", "nameIdentifierScheme": "WEKO"}], "names": [{"name": "Yamamoto, Tadashi"}]}]}, "item_7_publisher_7": {"attribute_name": "出版者", "attribute_value_mlt": [{"subitem_publisher": "新潟医学会"}]}, "item_7_select_19": {"attribute_name": "著者版フラグ", "attribute_value_mlt": [{"subitem_select_item": "publisher"}]}, "item_7_source_id_11": {"attribute_name": "書誌レコードID", "attribute_value_mlt": [{"subitem_source_identifier": "AN00182415", "subitem_source_identifier_type": "NCID"}]}, "item_7_source_id_9": {"attribute_name": "ISSN", "attribute_value_mlt": [{"subitem_source_identifier": "00290440", "subitem_source_identifier_type": "ISSN"}]}, "item_creator": {"attribute_name": "著者", "attribute_type": "creator", "attribute_value_mlt": [{"creatorNames": [{"creatorName": "木下, 直彦"}], "nameIdentifiers": [{"nameIdentifier": "60875", "nameIdentifierScheme": "WEKO"}]}, {"creatorNames": [{"creatorName": "山本, 格"}], "nameIdentifiers": [{"nameIdentifier": "60876", "nameIdentifierScheme": "WEKO"}]}]}, "item_files": {"attribute_name": "ファイル情報", "attribute_type": "file", "attribute_value_mlt": [{"accessrole": "open_date", "date": [{"dateType": "Available", "dateValue": "2019-08-06"}], "displaytype": "detail", "download_preview_message": "", "file_order": 0, "filename": "129(4)_180-186.pdf", "filesize": [{"value": "2.2 MB"}], "format": "application/pdf", "future_date_message": "", "is_thumbnail": false, "licensetype": "license_free", "mimetype": "application/pdf", "size": 2200000.0, "url": {"label": "129(4)_180-186.pdf", "url": "https://niigata-u.repo.nii.ac.jp/record/8730/files/129(4)_180-186.pdf"}, "version_id": "50958cc9-a84c-4631-adfa-903c23be8076"}]}, "item_keyword": {"attribute_name": "キーワード", "attribute_value_mlt": [{"subitem_subject": "抗体", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "情報検索", "subitem_subject_scheme": "Other"}, {"subitem_subject": "バイオインフォマティクス", "subitem_subject_scheme": "Other"}]}, "item_language": {"attribute_name": "言語", "attribute_value_mlt": [{"subitem_language": "jpn"}]}, "item_resource_type": {"attribute_name": "資源タイプ", "attribute_value_mlt": [{"resourcetype": "departmental bulletin paper", "resourceuri": "http://purl.org/coar/resource_type/c_6501"}]}, "item_title": "英語論文から抗体情報を取得する検索モデル", "item_titles": {"attribute_name": "タイトル", "attribute_value_mlt": [{"subitem_title": "英語論文から抗体情報を取得する検索モデル"}, {"subitem_title": "英語論文から抗体情報を取得する検索モデル", "subitem_title_language": "en"}]}, "item_type_id": "7", "owner": "1", "path": ["456", "912"], "permalink_uri": "http://hdl.handle.net/10191/44052", "pubdate": {"attribute_name": "公開日", "attribute_value": "2016-09-29"}, "publish_date": "2016-09-29", "publish_status": "0", "recid": "8730", "relation": {}, "relation_version_is_last": true, "title": ["英語論文から抗体情報を取得する検索モデル"], "weko_shared_id": null}