{"created":"2021-03-01T06:09:25.064838+00:00","id":5556,"links":{},"metadata":{"_buckets":{"deposit":"d55a2134-435f-4d17-8eba-352070513741"},"_deposit":{"id":"5556","owners":[],"pid":{"revision_id":0,"type":"depid","value":"5556"},"status":"published"},"_oai":{"id":"oai:niigata-u.repo.nii.ac.jp:00005556","sets":["453:455","471:561:562"]},"item_6_alternative_title_1":{"attribute_name":"その他のタイトル","attribute_value_mlt":[{"subitem_alternative_title":"Search Model to extract antibody information from English 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-製造会社の関係性を取得する抗体情報検索モデルを作成した.その後,UniProtのタンパク質データベースを用い,自動的に抗原となるタンパク質を検索/検出し,製造会社と関連付け,リポジトリ化する抗体情報自動検索ツールを作成し,その性能の検証を行った.【結果】抗体情報検索モデルの検証を行ったところ,適合率100%,再現率99.0%,F値99.5%という結果 いう結果であった.次に,抗体情報検索ツールの性能検証を行ったところ,適合率は100%であったが,再現率が39.8%と大きく減少し,結果としてF値は56.9% と著しい信頼度の低下が見られた.そこで,その原因を調査したところ,抗体情報が取得できなかった原因の72.3%は,動物種が異なる同名タンパク質がUniProtデータベースに登録されていたため,タンパク質を特定できなかったものであった。そのため、データベースを動物種別に再構築し, 再度検証を行ったところ,再現率は79.6% まで上昇し,F値も88.6%という高い信頼率なった.【考察】今回の抗体情報検索モデルについてはF値が99.5%という高い信頼性を示したため,このモデルは抗体情報取得に有効であると考えられた.また,抗体情報検索ツールでは,当初再現率が39.8% と, 著 しい低下がみられたが,動物種ごとにタンパク質デーセットを編成し,再検証した結果,再現率が79.6% まで上昇し,F値も88.6%という信頼率まで改善された.また,再構築後の抗体情報検索ツールについて,論文別の信頼度調査を行ったところ,F値が0.8 以上の論文が全体の80.9 %を占めたことから,本研究で作成した抗体情報検索ツールは,研究者が抗体選定する際に有用であると考えられた.今後この仕組みを改良/発展させることで、さらに多くの研究者に有用な抗体情報検索ツールを構築してゆきたいと考えている.","subitem_description_type":"Abstract"}]},"item_6_description_5":{"attribute_name":"内容記述","attribute_value_mlt":[{"subitem_description":"学位の種類: 博士(医学). 報告番号: 甲第3985号. 学位記番号: 新大院博(医)甲第631号. 学位授与年月日: 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