{"created":"2021-03-01T06:09:24.939514+00:00","id":5554,"links":{},"metadata":{"_buckets":{"deposit":"6a27edf5-15b8-4cce-a833-f62cec836386"},"_deposit":{"id":"5554","owners":[],"pid":{"revision_id":0,"type":"depid","value":"5554"},"status":"published"},"_oai":{"id":"oai:niigata-u.repo.nii.ac.jp:00005554","sets":["453:455","471:561:562"]},"item_6_alternative_title_1":{"attribute_name":"その他のタイトル","attribute_value_mlt":[{"subitem_alternative_title":"Development of a program for automatic extracting and subtracting contaminant information from mass spectrometry-identified 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へのコンタミが問題となっている。この問題を解決するため、 Microsoft社のプログラミング言語 VBA ：Visual Basic For Applicationを用いExcelアプリケーション機能をカスタマイズすることにより、MSタンパク質検索エンジン（MASCOT）より出力されたタンパク質同定結果から簡便に注目するタンパク質のSI_Nを表示させ、サンプル中にフケ（dandruff, D）による汚染があった場合にフケ由来タンパク質の強度 （SI_<GI>）を減算しフケ混入分を除き、サンプル本来のSI_N値を求めた値SI_N(-D) を表示するプログラムの開発を行った。プログラムの開発にあたっては、Western blottingによりフケに発現しているケラチンの確認を行い、その後、ヒトの腎組織（皮質）由来ペプチドサンプルに予め調整したフケペプチドを5% 、10% 、20% 、30%、50% 、60%、80% 、100%の割合で添加した後に質量分析し、それらのタンパク質同定結果からフケ特異的ケラチン： KRT1 、KRT10 をフケの内部標準物質として、それらのSI_<GI>回帰分析により、 フケの混入率を推測することが可能になった。本研究では、ペプチドサンプルのMASCOT同定結果から調べたいタンパク質の同定情報をスペクトル指数 （SI_N）として表示し、フケによるコンタミが判明した場合、フケ成分のタンパク質分を除去するプログラム、SI_N(-D) を開発した。SI_N(-D) は、フケ混入率が80％までフケ混入がないサンプルのSI_Nと有意差はなかったが、フケ混入率が30 ％を超えるとサンプル中の元サンプルタンパク質量が減少することによりそれらのタンパク質自体が同定さないケースも発生したため、データの信頼性は極端に低下したと考えられる。そのため 30 ％を超えるコンタミが判明した場合は、そのデータを使用しないことが望ましいと考えられた。","subitem_description_type":"Abstract"}]},"item_6_description_5":{"attribute_name":"内容記述","attribute_value_mlt":[{"subitem_description":"学位の種類: 博士（医学）. 報告番号: 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