{"created":"2021-03-01T06:40:30.201642+00:00","id":34052,"links":{},"metadata":{"_buckets":{"deposit":"ee3e807a-ac0c-479d-98d3-175efe800c7b"},"_deposit":{"id":"34052","owners":[],"pid":{"revision_id":0,"type":"depid","value":"34052"},"status":"published"},"_oai":{"id":"oai:niigata-u.repo.nii.ac.jp:00034052","sets":["453:456","471:537:538:2006"]},"item_7_alternative_title_1":{"attribute_name":"その他のタイトル","attribute_value_mlt":[{"subitem_alternative_title":"Alteration of TDP-43 Autoregulation-relevant Splicing by DNA Methylation Status of TARDBP DNA"}]},"item_7_biblio_info_6":{"attribute_name":"書誌情報","attribute_value_mlt":[{"bibliographicIssueDates":{"bibliographicIssueDate":"2019-04","bibliographicIssueDateType":"Issued"},"bibliographicIssueNumber":"4","bibliographicPageEnd":"172","bibliographicPageStart":"159","bibliographicVolumeNumber":"133","bibliographic_titles":[{"bibliographic_title":"新潟医学会雑誌"}]}]},"item_7_description_4":{"attribute_name":"抄録","attribute_value_mlt":[{"subitem_description":"筋萎縮性側索硬化症(ALS)は運動神経細胞が障害される神経変性疾患であり，病理学的には核蛋白であるTAR DNA-binding protein of 43kDa(TDP-43)が細胞質に蓄積する．TDP-43をコードするTARDBPの発現量の異常は，神経細胞死をもたらし，ALSにおけるTDP-43病理に関与する．しかし，孤発性ALSにおいてTARDBPの発現を乱す初期因子は明らかではない．生理的な条件下では，TDP-43は，TARDBP pre-mRNAの3'側非翻訳領城(3'UTR)内のイントロン7に結合し，選択的スプライシングを介して，自身の発現量を厳密に調節している．ALS病態には，このTARDBP pre-mRNA 3'UTRの選択的スプライシングに関与する因子が関わると考えられるが，孤発性ALSにおいて，その因子は不明である．遺伝子発現に大きく寄与する因子であるDNAのメチル化は，選択的スプライシングにも影響を及ぼす．本研究では，TARDBP 3'UTRのDNAメチル化状態がTARDBP発現量に寄与する可能性を検証するため，dCas9を利用したゲノム編集の手法を用い，HEK293T細胞におけるTARDBP 3'UTRのメチル化シトシン(CpG)部位を選択的に脱メチル化させた．その結果，TARDBP mRNAの選択的スプライシング効率が減弱し，発現量は約2倍に増加した．さらに，TARDBP 3'UTRに着目したバイサルファイトアンプリコンシークエンシング解析は，運動野皮質においてTARDBPイントロン7内のCpG部位のDNAメチル化率が，選択的スプライシング効率と正相関することを示した．TARDBPイントロン7に存在する6か所のCpG部位のDNAメチル化状態は，脳領域(運動野皮質，後頭葉皮質および小脳半球)に依存して異なっていた．加えて，運動野皮質では，この6か所のCpG部位のDNAメチル化率と年齢は逆相関を示した．選択的スプライシングに寄与する，TARDBPイントロン7のDNAメチル化状態は，細胞の状況や外的要因の影響を受けやすい．特に，ALSの罹患領域である運動野皮質において，TARDBPイントロン7のDNAメチル化状態の特性を見出したことは，孤発性ALS病態への寄与を考える上で，興味深い．今後，孤発性ALS患者脳において，TARDBPのDNAメチル化状態が変容しているか，明らかにしていく必要がある．","subitem_description_type":"Abstract"}]},"item_7_full_name_3":{"attribute_name":"著者別名","attribute_value_mlt":[{"nameIdentifiers":[{"nameIdentifier":"175146","nameIdentifierScheme":"WEKO"}],"names":[{"name":"Koike, Yuka"}]}]},"item_7_publisher_7":{"attribute_name":"出版者","attribute_value_mlt":[{"subitem_publisher":"新潟医学会"}]},"item_7_select_19":{"attribute_name":"著者版フラグ","attribute_value_mlt":[{"subitem_select_item":"publisher"}]},"item_7_source_id_11":{"attribute_name":"書誌レコードID","attribute_value_mlt":[{"subitem_source_identifier":"AN00182415","subitem_source_identifier_type":"NCID"}]},"item_7_source_id_9":{"attribute_name":"ISSN","attribute_value_mlt":[{"subitem_source_identifier":"00290440","subitem_source_identifier_type":"ISSN"}]},"item_creator":{"attribute_name":"著者","attribute_type":"creator","attribute_value_mlt":[{"creatorNames":[{"creatorName":"小池, 佑佳"}],"nameIdentifiers":[{"nameIdentifier":"64665","nameIdentifierScheme":"WEKO"}]}]},"item_files":{"attribute_name":"ファイル情報","attribute_type":"file","attribute_value_mlt":[{"accessrole":"open_date","date":[{"dateType":"Available","dateValue":"2020-09-14"}],"displaytype":"detail","filename":"133(4)_159-172.pdf","filesize":[{"value":"7.5 MB"}],"format":"application/pdf","licensetype":"license_note","mimetype":"application/pdf","url":{"label":"133(4)_159-172","url":"https://niigata-u.repo.nii.ac.jp/record/34052/files/133(4)_159-172.pdf"},"version_id":"8b7a79c1-46d6-4b27-b5b2-59ffd405324a"}]},"item_keyword":{"attribute_name":"キーワード","attribute_value_mlt":[{"subitem_subject":"筋萎縮性側索硬化症","subitem_subject_scheme":"Other"},{"subitem_subject":"TARDBP遺伝子","subitem_subject_scheme":"Other"},{"subitem_subject":"DNAメチル化","subitem_subject_scheme":"Other"},{"subitem_subject":"自己調節機構","subitem_subject_scheme":"Other"},{"subitem_subject":"選択的スプライシング","subitem_subject_scheme":"Other"}]},"item_language":{"attribute_name":"言語","attribute_value_mlt":[{"subitem_language":"jpn"}]},"item_resource_type":{"attribute_name":"資源タイプ","attribute_value_mlt":[{"resourcetype":"departmental bulletin paper","resourceuri":"http://purl.org/coar/resource_type/c_6501"}]},"item_title":"TARDBP DNAメチル化状態によるTDP-43の自己調節機構関連スプライシングの変化","item_titles":{"attribute_name":"タイトル","attribute_value_mlt":[{"subitem_title":"TARDBP DNAメチル化状態によるTDP-43の自己調節機構関連スプライシングの変化"}]},"item_type_id":"7","owner":"1","path":["456","2006"],"pubdate":{"attribute_name":"公開日","attribute_value":"2020-09-14"},"publish_date":"2020-09-14","publish_status":"0","recid":"34052","relation_version_is_last":true,"title":["TARDBP DNAメチル化状態によるTDP-43の自己調節機構関連スプライシングの変化"],"weko_creator_id":"1","weko_shared_id":2},"updated":"2022-12-15T04:04:24.223307+00:00"}